当胎儿从母体娩出，工作人员会立即将脐带血采集到专用血袋内；脐带血通过专业冷链运输送至脐血库后，会进行包括母血检查、脐血称重、消毒等多项工作，最终将合格脐血进行条形码信息登记，即样本被标识唯一性。
进入层流洁净实验室后，脐带血中的干细胞被制备分离，并留样进行传染病检测、流式检测、HLA 分型、细胞数量及增殖能力检测、血型检测等。
脐带血在制备后会被注入冷冻保护剂，最终通过 -196 ℃的液氮超低温环境进行长期冻存。此阶段注入的冷冻保护剂不仅不会改变脐带血的有效成分，还能在脐血降温和复苏阶段最大限度保持脐血活性，确保它在未来某一天焕发生命活力。
